杜蘭被困在束縛衣里，被推著，直接送手術(shù)室，先提取一些基因。
加持良治和真希波都知道杜蘭在第三新東京市大鬧了一場(chǎng)，都來(lái)看看這個(gè)杜蘭到底是何方神圣。
“駕駛看來(lái)也不是很難。”真希波很快也要上了，所以她覺(jué)得杜蘭給她做了一個(gè)好榜樣。
真希波和加持良治都是s的員工，不過(guò)他們兩人的目標(biāo)并不一樣。加持主要是為了尋找真相，而碇源堂司令也正是用真相作為交易，才讓加持為他服務(wù)。
加持雖然已經(jīng)是s的員工，但并沒(méi)有機(jī)會(huì)進(jìn)去祭壇核心，現(xiàn)在他還只能算是武士中的下士，屬于邊緣，想要知道核心，只怕是很難做到。但這個(gè)時(shí)候司令的交易讓他心動(dòng)，所以加持成為了多面間諜。
真希波則是為了學(xué)姐，也就是碇真嗣的老媽。沒(méi)錯(cuò)，雖然真希波看著好像是個(gè)少女，其實(shí)是個(gè)阿姨。她是受到了的詛咒，不會(huì)長(zhǎng)大了，她也是冬月的學(xué)生，并且憧憬碇真嗣的老媽?zhuān)运哪繕?biāo)就是幫憧憬的學(xué)姐照顧兒子。不過(guò)現(xiàn)在她也不知道碇真嗣在整個(gè)計(jì)劃中到底是起到了什么作用，她得慢慢調(diào)查。她知道如果學(xué)姐活著，碇源堂做的事情肯定都是違背學(xué)姐意圖的。學(xué)姐雖然是s的人，但其實(shí)并不是什么消極的人，她是給身邊的人帶來(lái)希望的女神，聰明、美麗、堅(jiān)強(qiáng)、勇敢，所以碇唯希望的世界就是真希波希望的世界。這樣的世界絕對(duì)不是混亂的，也不會(huì)是人類(lèi)補(bǔ)完計(jì)劃，一定是能讓所有人都幸福的世界，至少她的兒子能在這個(gè)世界里真心地微笑。
杜蘭知道自己要被送去研究了，心想這樣的話(huà)，那他們會(huì)不會(huì)克隆很多個(gè)自己，然后再讓自己返老還童？然后有一群少年杜蘭到處亂竄。
杜蘭可不想被研究，所以他給保鏢送去了信號(hào)，現(xiàn)在他可以發(fā)動(dòng)進(jìn)攻了。
此時(shí)保鏢正地站在大海之上，一支活生生的生物艦隊(duì)正在乘風(fēng)破浪，一個(gè)名為迪妮莎的女人找到了他，要和他一起幫忙救助杜蘭。同時(shí)他也越發(fā)確定自己是在一個(gè)虛假的世界里，因?yàn)榈夏萆屗谝粋�(gè)生物機(jī)器上，帶上一根臍帶，大腦里就多出了大量的技術(shù)，現(xiàn)在他掌握了全世界所有的交通工具，同時(shí)也學(xué)會(huì)了全世界的格斗方式，就好像他天生都會(huì)這些知識(shí)。
如果不是虛擬的世界，怎么可能通過(guò)這種方法傳輸知識(shí)？只怕連神經(jīng)元也沒(méi)有這樣的力量。再說(shuō)生物艦隊(duì)，長(zhǎng)得都好像使徒，也不知道使用什么能源就能在大海上風(fēng)馳電掣，這應(yīng)該是地效飛行器的原理，貼在海面，全速前進(jìn)。已經(jīng)看到前面陰云下的伯大尼基地了，那是建立在大海之上的神經(jīng)元基地。
“本來(lái)都沒(méi)什么錢(qián)了，還這么浪費(fèi)把基地建設(shè)在大海上，真是閑的。”迪妮莎對(duì)于s的鋪張浪費(fèi)表達(dá)了批判。
不過(guò)對(duì)于封建組織來(lái)說(shuō)，花錢(qián)營(yíng)造神秘感是必須的，畢竟如果被祭壇外的人發(fā)現(xiàn)祭壇里面的人也都是兩個(gè)眼睛一個(gè)鼻子一張嘴的普通人，那s的高層不是很尷尬？所以必須做一些不明覺(jué)厲的東西，拉開(kāi)他們和祭壇外的距離。
有了這些高大上的設(shè)備，祭壇外的人才會(huì)敬而遠(yuǎn)之，因?yàn)楹ε潞臀窇侄桓逸p易冒險(xiǎn)試探。
至于浪費(fèi)錢(qián)財(cái)和資源，那本來(lái)就是應(yīng)該的，反正最后人類(lèi)補(bǔ)完，這些資源人類(lèi)也用不上，還不如浪費(fèi)算了。
什么，你說(shuō)有人吃不上飯？這和s有什么關(guān)系，他們只負(fù)責(zé)和使徒戰(zhàn)斗，吃飯問(wèn)題是每個(gè)地區(qū)的政府負(fù)責(zé)。
“我們走吧。”迪妮莎的細(xì)腰上戴著立體機(jī)動(dòng)，直接起飛。
殺手也一樣跟著，兩人直接潛入基地。顯然基地也沒(méi)想到會(huì)有人單槍匹馬潛入進(jìn)來(lái)，根本沒(méi)有對(duì)人作戰(zhàn)的經(jīng)驗(yàn)。
兩人身穿光學(xué)迷彩服長(zhǎng)驅(qū)直入，直接進(jìn)入了手術(shù)臺(tái)。就在杜蘭要被解剖的時(shí)候，他們迅速打暈了手術(shù)室里的所有人。
“老婆，你可算來(lái)救我了，我好怕怕。”杜蘭表示真怕自己控制不了直接就動(dòng)手了。
迪妮莎表示杜蘭就是喜歡搞怪：“你故意被他們抓，還不是為了潛入基地。你想在這里找什么？”
伯大尼的基地里有在建的五號(hào)機(jī)，還有四只亞當(dāng)力量組成的鑰匙。當(dāng)然還有加持良治和真希波兩個(gè)劇情角色，還有一些小秘密，關(guān)于人工智能的，也關(guān)于克隆人的。
克隆人在s里不算少見(jiàn)，但和克隆人一起工作卻不見(jiàn)得就是一件愉快的事情。對(duì)于很多人來(lái)說(shuō)，克隆人不值得信任。
比如真希波就不喜歡克隆人，赤木律子也不喜歡。
當(dāng)然赤木律子不喜歡克隆人主要還是不喜歡綾波麗，畢竟綾波麗獲得了太多的關(guān)心，特別是司令的關(guān)心。
當(dāng)然在劇場(chǎng)版里連明日香都是克隆的，不過(guò)明日香的克隆使用的是淘汰制，最后活下來(lái)的就是現(xiàn)在這個(gè)明日香，也是個(gè)自閉少女。
所以理論上來(lái)說(shuō)駕駛員都應(yīng)該是克隆人才對(duì)，所以碇源渡把自己兒子送上去是完全違背s計(jì)劃的，不過(guò)碇真嗣也是爭(zhēng)氣，接連打敗了使徒。
碇源堂這也是一招險(xiǎn)棋，不過(guò)他對(duì)妻子有信心，他相信有妻子靈魂的初號(hào)機(jī)不會(huì)讓他失望的。至于兒子的話(huà)，碇源堂是真沒(méi)放在心上，在他看來(lái)不是兒子給力，而是老婆給力。
“現(xiàn)在我們干什么？”
“當(dāng)然是包圍基地了。”
殺手表示如果換了別人說(shuō)三個(gè)人包圍一個(gè)基地，他肯定不相信，杜蘭的話(huà)絕對(duì)完全沒(méi)問(wèn)題，他相信杜蘭真的可以做到。
于是三人拿著武器開(kāi)始了行動(dòng)，利用光學(xué)迷彩直接潛入指揮室，再展現(xiàn)身形大吼一聲：“你們已經(jīng)被我們?nèi)齻�(gè)人包圍了。”特別點(diǎn)出只有三個(gè)人，杜蘭簡(jiǎn)直就是惡趣味。
指揮室的人面面相覷，表示這三個(gè)人是虛張聲勢(shì)，還是腦子有坑？不過(guò)沉默也只是一瞬之間，很快警報(bào)就響起來(lái)了，外面的保安部隊(duì)正在荷槍實(shí)彈地聚集起來(lái)，如果真的只有三個(gè)人的話(huà)，等會(huì)兒他們就會(huì)變成馬蜂窩，因?yàn)橥饷娴陌脖２筷?duì)少說(shuō)也有三十個(gè)人，是他們的十倍。
“好啊你們，不但不投降，竟然還敢反抗？！”杜蘭表示真是反了，伯大尼基地里的人這是自尋死路。
當(dāng)然杜蘭不會(huì)殺他們，他的武器都是恰好可以把人打暈的能量武器，非常安全，但無(wú)限子彈，射術(shù)也非常快。
很快基地內(nèi)部就開(kāi)始了槍?xiě)?zhàn)，不過(guò)并沒(méi)有持續(xù)多久，最后站著的只有兩個(gè)半，殺手累得夠嗆正癱做在地板上休息呢，只有杜蘭和迪妮莎兩夫妻是站著筆直，宣布伯大尼基地已經(jīng)易主。
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