正所謂一山不能容二虎，除非一公和一母，但亞當(dāng)與莉莉絲雖然名字上看起來(lái)是一男一女，但實(shí)際上卻并沒(méi)有性別這一概念，因?yàn)樗鼈兩砭褪且环N接近永生的類神生命體，完依賴生命之樹(shù)與智慧之樹(shù)播撒遺傳因子讓自己達(dá)成永生，根不需要通過(guò)兩性生殖來(lái)繁衍后代。rg
不只因?yàn)槿绱耍捎趤啴?dāng)?shù)陌字乱呀?jīng)懸浮于地球衛(wèi)星軌道上，莉莉絲對(duì)引力的計(jì)算發(fā)生誤差，導(dǎo)致黑之月登錄失敗，就這么直接撞進(jìn)了地球里。
這直接導(dǎo)致地球受到了劇烈的沖擊，造成了當(dāng)時(shí)幾乎立于生物鏈頂點(diǎn)的恐龍因此滅族，從而導(dǎo)致了亞當(dāng)?shù)牡谑孱w生命之果回收失敗。而這次撞擊，就是史稱第一次撞擊的物種大滅絕事件。
不過(guò)莉莉絲并沒(méi)有任何的猶豫，在登陸后就立刻開(kāi)啟了“轉(zhuǎn)生計(jì)劃”，通過(guò)黑之月上的智慧之樹(shù)，將自己的智慧因子灑向大地，催生了不以**力量取勝，而是靠著智慧立于食物鏈頂端的生命——人類，從某種意義上，莉莉絲確實(shí)是這個(gè)世界所有人類的母親沒(méi)錯(cuò)了。
起來(lái)亞當(dāng)和莉莉絲的行為模式與最終幻想中的杰諾瓦細(xì)胞非常類似，只不過(guò)杰諾瓦細(xì)胞進(jìn)行宇宙旅行是為了汲取星球的生命能量，亞當(dāng)是為了獲取更強(qiáng)的身體，而莉莉絲則是為了更強(qiáng)的智慧。
亞當(dāng)惱怒莉莉絲打亂了自己的計(jì)劃，與莉莉絲進(jìn)行了一場(chǎng)驚世大戰(zhàn)，那場(chǎng)戰(zhàn)斗可以是天昏地暗，日月無(wú)光，戰(zhàn)斗中，智慧樹(shù)被毀滅，黑之月被打入地殼，生命之樹(shù)重傷，樹(shù)根化作后來(lái)的“朗基努斯槍”。亞當(dāng)能量殆盡，失去行動(dòng)能力的他只好等待使徒從生命之果中覺(jué)醒，完成補(bǔ)從而乘坐月球離開(kāi)，再次開(kāi)始循環(huán)，而莉莉絲則同樣重傷頻死，落了個(gè)下半身被蒸發(fā)的下場(chǎng)。
由于智慧之樹(shù)被毀，莉莉絲無(wú)力回收智慧之果，在無(wú)奈之下將自己的生命因子和已經(jīng)結(jié)成的生命之果進(jìn)行置換（也就是想要將這些使徒體內(nèi)的亞當(dāng)細(xì)胞轉(zhuǎn)化成自己的細(xì)胞，同時(shí)也將生命之果中的一部分生命因子同化，這樣才能夠讓自己和生命之果擁有聯(lián)系，從而在將來(lái)獲得這份肉*體這也是后來(lái)為什么使徒會(huì)把莉莉絲當(dāng)成亞當(dāng)?shù)脑颍@個(gè)過(guò)程要持續(xù)千百萬(wàn)年，直到同化結(jié)束生命之果才能孵化），并存放于世界各地，自身則進(jìn)入冰層沉睡，一邊養(yǎng)傷一邊等待生命之果孵化，企圖東山再起。
但是莉莉絲降臨地球時(shí)擴(kuò)散出去的智慧因子已經(jīng)開(kāi)始發(fā)揮作用，慢慢進(jìn)化出了人類，六千五百萬(wàn)年后，人類在南極發(fā)現(xiàn)了假死狀態(tài)的亞當(dāng)，因?yàn)榈厍蛏纤猩锒紦碛衼啴?dāng)?shù)纳蜃樱▉啴?dāng)?shù)纳蜃蛹訌?qiáng)的是整個(gè)星球的進(jìn)化速度，但只有進(jìn)化的最強(qiáng)的生物在滅絕后才能變成生命之果），引發(fā)了亞當(dāng)?shù)奶K醒，造成了第二次沖擊，但區(qū)區(qū)一支科考隊(duì)的人類的生命因子并不足以完復(fù)活亞當(dāng)，亞當(dāng)只能尷尬的處于“靈魂守衛(wèi)放了一波大，結(jié)果發(fā)現(xiàn)目標(biāo)血量還沒(méi)自己多”的尷尬場(chǎng)面。
然后，人類找到了能量用盡的亞當(dāng)，并持續(xù)抽取它的能量，最終迫使其退化到胚胎狀態(tài)以維持生命，最后甚至被人類封印在樹(shù)脂之中。
而在這個(gè)過(guò)程中，亞當(dāng)也強(qiáng)行催化出了第十五顆生命之果——也就是后來(lái)的渚薰，因?yàn)檫@顆生命之果先天不足（沒(méi)有集合一個(gè)種族，僅僅吸收了科考隊(duì)那幾個(gè)人），因此孵化出的個(gè)體能夠保持自我。
后來(lái)，人類發(fā)現(xiàn)了莉莉絲的殘軀，并獲知了莉莉絲的計(jì)劃死海文書(shū)，個(gè)人認(rèn)為死海文書(shū)是一道精神意念而非真正的文字，企圖通過(guò)人類補(bǔ)完讓人類逆襲莉莉絲，獲得永久生命的同時(shí)，也不再有任何隔閡，具體方法是通過(guò)類似妊辰的作用，讓人類的人類意識(shí)匯于一體，以莉莉絲為母體，誕生而出，取代莉莉絲掌握生命之樹(shù)和黑之月，進(jìn)行宇宙旅行。
而這個(gè)計(jì)劃的重點(diǎn)，就是人類補(bǔ)完計(jì)劃的主導(dǎo)權(quán)。
因此，人類效仿第十五顆生命之果的事件，從莉莉絲體內(nèi)提煉出了智慧因子（因?yàn)闆](méi)有智慧樹(shù)，所以只是因子，肉*體需要人工培育），并孕育出了綾波麗，同樣也用生命之果和智慧之果的技術(shù)培育出了eva，而作為祭品的就是碇真嗣的母親碇唯，碇唯的身體成為了智慧因子的載體，最終產(chǎn)生了無(wú)數(shù)綾波麗，而碇唯的靈魂則進(jìn)入了eva，代替了來(lái)需要犧牲一整個(gè)種族才能凝聚的種族意識(shí)（零號(hào)機(jī)直接就是莉莉絲的靈魂，二號(hào)機(jī)有明日香母親的一部分靈魂，東治的三號(hào)機(jī)和設(shè)定里有提到里面有東治他媽的靈魂）。
隨后，所有生命之果的置換完成，并逐漸開(kāi)始孵化，按照生命之樹(shù)的規(guī)則，進(jìn)行如同養(yǎng)蠱般的戰(zhàn)斗，并尋找亞當(dāng)（當(dāng)然了，此時(shí)因?yàn)轶w內(nèi)因子的關(guān)系，找的實(shí)際上是莉莉絲）。
人類按照計(jì)劃，成功戰(zhàn)勝了所有使徒，并獲得了與莉莉絲融合的權(quán)利。
不過(guò)這時(shí)候，人類的劣根性便爆發(fā)了出來(lái)，魂之座（SEELE）每一個(gè)都想要成為人類補(bǔ)完計(jì)劃的主體，于是培育搭載s機(jī)關(guān)的量產(chǎn)機(jī)，襲擊了NERV，不過(guò)碇原堂終究技高一籌，早在這之前就已經(jīng)將亞當(dāng)?shù)呐咛ブ踩肓俗约旱挠沂郑?huà)里是吃下去然后出現(xiàn)在左手），借由亞當(dāng)胚胎和自己與綾波麗的關(guān)系，理所當(dāng)然會(huì)成為最后的主體，只有這樣，才能夠達(dá)成碇源堂內(nèi)心深處的那個(gè)愿望——與碇唯重新見(jiàn)面。
但就如亞當(dāng)被莉莉絲的到來(lái)而打擾一樣，任何事情都不會(huì)嚴(yán)絲合縫的按照你的想法行動(dòng)，初號(hào)機(jī)通過(guò)吞噬力天使，十分湊巧的擁有了亞當(dāng)和莉莉絲的因子（當(dāng)然還有s機(jī)關(guān)），使得碇真嗣同樣具備這個(gè)資格，于是在最后時(shí)刻，選擇了碇真嗣的綾波麗，最終打斷了人類補(bǔ)完計(jì)劃，這也就是《真心為你》的劇情了。（至于新劇場(chǎng)版，除了畫(huà)風(fēng)感人和燃燒經(jīng)費(fèi)之外，我只當(dāng)那是騙錢(qián)的再創(chuàng)作）
而整個(gè)故事中，最值錢(qián)的一部分，應(yīng)該就是最后的人類補(bǔ)完了，不過(guò)巴別塔世界禁止更換血統(tǒng)，所以這部分對(duì)馮雪來(lái)沒(méi)啥用，反倒是莉莉絲最后那一發(fā)直接將人類橙汁化的反AT力場(chǎng)很有意思，馮雪覺(jué)得如果學(xué)會(huì)了這一招，就可以在不進(jìn)行殺戮的前提下，直接將整個(gè)位面的人類精神化，然后收進(jìn)自己的心象世界了。
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