嘉靖皇帝此時身體已經很差了，他在死前立下遺詔：”朕以宗人入繼大統，獲奉宗廟四十五年。深惟享國久長，累朝未有。乃茲弗起，夫復何恨！但念朕遠奉列圣之家法，近承皇考之身教，一念惓惓，本惟敬天助民是務，只緣多病，過求長生，遂致奸人乘機誑惑，禱是日舉，土木歲興，郊廟之祀不親，明講之儀久廢，既違成憲，亦負初心。邇者天啟朕衷，方圖改徹，而據嬰仄疾，補過無由，每思惟增愧恨。“
胡子睿知道這里的奸人指的乃是嚴嵩、嚴世藩一黨，在這里嘉靖皇帝承認海瑞說的大都是正確的。
嘉靖皇帝遺詔繼寫道：“蓋愆成昊端伏，后賢皇子裕至。仁孝天植，睿智夙成。宜上遵祖訓，下順群情，即皇帝位。勉修令德，勿遇毀傷。喪禮依舊制，以日易月，二十七日釋服，祭用素饈，毋禁民間音樂嫁娶。宗室親、郡王，藩屏為重，不可擅離封域。各處總督鎮巡三司官地方攸系不可擅去職守，聞喪之日，各止于本處朝夕哭臨，三日進香差官代行。衛所、府、州、縣并土官俱免進香。郊社等禮及朕祔葬祀享，各稽祖宗舊典，斟酌改正。
自即位至今，建言得罪諸臣，存者召用，歿者恤錄，見監者即先釋放復職。方士人等，查照情罪，各正刑章，齋蘸工作采買等項不經勞民之事悉皆停止。于戲！子以繼志述事并善為孝，臣以將順匡救兩盡為忠。尚體至懷，用欽未命，詔告天下，咸使聞之。“
隆慶皇帝繼位后，將楊繼盛列為撫恤錄的頭名，給他的評價是“剛方秉性，慷慨致身”，又云：“死者不可復生，百身難贖枉者不可不直，三命宜頒。遵遺詔以加恩，憫孤忠而錫恤。特贈爾中順大夫，太常寺少卿，謚忠愍，葬祭，并加錄蔭。”又賜祠堂于保定，額曰：“旌忠”，兩邊還有一付對聯“鐵肩擔道義，辣手箸文章”！而京城的百姓也自發將楊繼盛的往處，改成城煌廟，將張氏供奉于內。
胡子睿知道旌本是指旌旗，引申為旗幟，也有表揚、表彰之意，而忠就更是褒義詞了，正所謂“天下至德，莫大乎忠。“
楊繼盛的沉冤既然已昭雪，于是他的老師，已經升任首輔的徐階也寫了道詩祭典自己的愛徒：”萬物稟氣以為命，公生其中得厥正。位卑身仆益自奮，君恩必報以死殉。人心為憤地為震，歲星一終天乃定。澌滅主明圣，易名建祠錫贈廕。制詞前后相輝映，嗟公一死重孰并。我銘揭之為世鏡。“
文壇后七子領袖，楊繼盛生前的好友王化貞也寫了首詩：”嗚呼，國家之所以為楊公者，足矣。當公再上疏再得罪以死，天下公之忠，痛公之冤，而不知公之功實在社稷。天下先帝之怒，公至僇其身，而不知再用公之言以格鸞嵩之奸，于后天下知，今上仁圣，數用言官言褒卿公，而不知其陰體，先帝之遺意。嗚呼，公可以含笑地下矣。“
海瑞被嘉靖皇帝關下監獄，一直是待罪之身，有一天，獄卒拿了一頓豐盛的酒菜，海瑞沒想到是嘉靖皇帝已經架崩了，自己馬上就可以自由了，還以為是處斬自己的上路酒，于是他放開手腳大吃了一頓。那天晚上，嘉靖皇帝架崩的消息傳來，海瑞于是“嚎啕大哭”，就像死了爹一樣傷心，整個監獄都能聽見海瑞的哭聲，海瑞一面哭，一面把自己吃的東西全部吐了出來。
沈煉被隆慶皇帝追封為光祿少卿，任免沈襄當官，沈襄于是上疏，揭露當年楊順、路楷、許論幾個人竄通嚴世蕃，陷害沈煉的罪行于是，法司追查當年的案卷，發現楊順、路楷、許論犯有殺良冒功、貪臟枉法的罪行，數罪并罰，判處斬刑。正是因為有了隆慶皇帝表彰楊繼盛等人的行為，打開了言路，為王崇古的隆慶和議、張居正后來的改革打下了理論基礎、良好范圍。
王崇古上疏曰：”先帝既誅仇鸞，制復言開市者斬，邊臣何敢故違禁旨，自陷重辟。但敵勢既異昔強，我兵亦非昔怯，不當援以為例。夫先帝禁開馬市，未禁北敵之納款。今敵求貢市，不過如遼東、開原、廣寧之規，商人自以有無貿易，非請復開馬市也。俺答父子兄弟橫行四五十年，震驚宸嚴，流毒畿輔，莫收遏劉功者，緣議論太多，文網牽制，使邊臣手足無所措耳。“
胡子睿知道王崇古指出現在的形勢已非嘉靖年間可比，更明確指出嘉靖皇帝也不會拒絕俺答投降。
王崇古續奏道：”昨秋，俺答東行，京師戒嚴，至倡運磚聚灰塞門乘城之計。今納款求貢，又必責以久要，欲保百年無事，否則治首事之罪。豈惟臣等不能逆料，他時雖俺答亦恐能保其身，不能制諸部于身后也。夫拒敵甚易，執先帝禁旨，一言可決。但敵既不得請，懷憤而去，縱以把漢之故，不擾宣、大，而土蠻三衛歲窺薊、遼，吉能、賓兔侵擾西鄙，息警無時，財務殫絀，雖智者無以善其后矣。昔也先以克減馬價而稱兵，忠順王以元裔而封哈密，小王子由大同二年三貢，此皆前代封貢故事。夫揆之時勢，既當俯從，考之典故，非今創始。堂堂天朝，容荒服之來王，昭圣圖之廣大，以示東西諸部，傳天下萬世，諸臣何疑憚而不為耶？”
王崇古用也先、忠順王、小王子等人的故事，來說服朝臣欲求百年無事的想法。
隆慶皇帝下旨對王崇古的奏章召開廷議，當時眾人各執其見，定國公徐文壁、吏部左侍郎張網維為首的二十二名大臣皆以為可議和英國公張溶、戶部尚書張守直為首的十七個名大臣以為不可議和工部尚書朱衡等五人以為可以封貢，不可以開互市。。。。。。兵部尚書郭乾始終拿不定主意。最后還是隆慶皇帝拍板，同意了王崇古的意見。
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